Что такое m54tu? Какого года выпуска этот двигатель?
Однозначно придётся менять педаль "газа" - у m52tu тросик, у m54 потенциометрический задатчик. Если меняется силовой агрегат с мозгами DME и EGS, то меняются и жгуты проводов. Впускной коллектор, EML, MAF - тоже нужно менять. Согласование DME - EWS. Возможно, несовместимость кардана. Передаточное отношение редуктора заднего моста, наверное, отличается. Крепление силового агрегата, если и отличается, то несильно.